头孢克肟和头孢曲松钠一般效果是一样的，但是用法有所不同。
头孢克肟和头孢曲松钠都属于头孢菌素类抗生素药物，对于革兰氏阳性球菌和革兰阴性杆菌都有很好地抑制和杀灭效果，但是对革兰阴性杆菌的抑菌效果要更好一些。两种药物虽然效果是一样的，但是用法不同。头孢克肟有散剂、颗粒、片剂等，主要是通过口服用药。头孢曲松钠是注射剂，主要通过肌肉注射或静脉注射。
头孢菌素类抗生素药物在服用时可能会产生过敏反应，若对药物成分过敏者禁止服用，孕妇、儿童等一定要在医生的指导下用药。另外，服用头孢菌素类抗生素药物期间不可以喝酒，避免发生双硫仑样反应。