连花清瘟一般是指连花清瘟胶囊或连花清瘟颗粒，其主要成分基本一致，遵医嘱服用后通常不会出现头痛症状，但部分用药不当或体质敏感的患者可能会在用药后感到头痛。
连花清瘟胶囊、连花清瘟颗粒均属于中成药制剂，由金银花、板蓝根、甘草等多种中药材制作而成，具有清热解毒的功效，在临床上常用于治疗流行性感冒引起的发热、咳嗽、肌肉酸痛等症状。如果患者在医生指导下使用这两种药物进行治疗，则产生的副作用相对较小，可能仅会出现轻微头晕、恶心以及腹胀等不适现象，通常停药后不适症状即可得到缓解。
但如果患者存在盲目增加剂量、频次等用药不当行为，或者体质比较敏感，则有可能会对神经系统造成影响，从而引起头痛的症状发生。此时建议患者及时停药，并严格遵医嘱进行治疗。
如果需要服用连花清瘟胶囊或连花清瘟颗粒，需要在医生指导下进行，避免私自用药导致药物副作用的发生，不利于病情恢复。