松果体瘤可能是良性，也可能是恶性。
松果体瘤发病原因并不明确，有可能是因为长时间接触高剂量的电离辐射，所以在生长发育过程中出现基因突变引发松果体瘤，也不排除是因为胚胎发育期间出现了罕见的综合症，所以引发了基因遗传突变。而松果体瘤大多数是属于良性，主要是因为这种肿瘤生长速度比较缓慢，早期不会有明显的异常症状。
但是有一小部分的松果体瘤有可能会偏向恶性，生长速度比较快，容易侵犯周围的组织，引发神经功能障碍。如果是属于良性的松果体瘤，可以选择手术切除，治愈率较高。如果是属于恶性的松果体瘤很难完全的自愈，手术过后可能容易复发。