临床上没有柴胡与黄芩最佳配比的说法，通常情况下，柴胡与黄芩在小柴胡汤中的配比是4：3。
柴胡是一种常见中药，味辛、苦，具有退热、解忧愁、固脱等功效，临床上用于治疗感冒发热、忽冷忽热、胸胁胀痛、月经不调、子宫脱垂、脱肛等病症。黄芩为唇形植物黄芩的干燥根，味苦，性寒，具有清热燥湿、泻火解毒、止血、安胎等功效，主治湿温、胸闷、恶心呕吐、黄疸、泻痢、肺热咳嗽等，还对于胎动不安、血热吐衄等病症有治疗作用。小柴胡汤是和解少阳的常用方剂，方中使用柴胡作为君药，有轻清升散、疏邪透表的功效，为少阳病专用药。黄芩性寒，具有清少阳相火的功效，作为臣药，与柴胡一散一清，共解少阳之邪的作用。二者中以柴胡为主，所以柴胡和黄芩常用的配比是4：3。
使用小柴胡汤需要在中医生辨证指导下使用，个人切勿盲目使用，以免造成不良后果。方中柴胡有疏邪透表的功效，不可长期、大量使用，避免出现不良反应。另外黄芩苦寒伤胃，脾胃虚寒者不可使用。