降香的副作用目前尚不明确，中医认为降香无毒，服用后不会造成不良反应，但对于阴虚火旺、血热妄行的人群不可服用。
降香味辛、性温，是具有化瘀止血、理气止痛功效的中药材，可辅助治疗淤血阻滞所引起的出血、气滞血瘀所引起的胸胁疼痛、跌伤瘀痛等症状，对于秽浊内阻脾胃所引起的呕吐、腹痛等症状，也有一定的辅助作用。患者遵医嘱服用降香，通常不会对机体造成不良影响，且中医认为降香并不含有毒素，服用后不会对身体产生副作用。
但由于降香属于性温的中药材，服用之后可起到温养机体的作用，对于本身患有阴虚火旺、血热妄行而无瘀滞的患者，通常不可以服用降香，以免因药物的温补作用而导致热邪强盛，引起病症加重的现象，不利于病情的治疗。
降香虽无毒，但并不建议长期服用，以免引起身体不适。