蜂窝的性味甘、平，归胃经，具有攻毒杀虫、祛风止痛等作用，需经过配比可用于治疗多种病证。建议在使用指导下应用，以免产生不良反应。
1、攻毒杀虫
蜂窝能攻毒杀虫、攻坚破积，可用于治疗疮疡肿毒、乳痈、瘰疬、顽癣瘙痒、鹅掌风等疾病。治疗疮疡肿毒时可以单用，也可与解毒消肿生肌药物同用，如与生南星、生草乌共研成细末，醋调后外敷。治疗瘰疬时建议与蛇蜕、黄芪、玄参等为膏外用，能够有效缓解瘙痒症状。而治头上癣疮时，建议使用用蜂房为沫，调猪油涂擦。
2、祛风止痛
蜂窝质地比较轻且善于走窜，具有祛风止痛、止痒等作用，可用于治疗风湿痹痛、牙痛、风疹瘙痒等疾病。将蜂窝内服后可以缓解类风湿、风湿性疾病引起的关节疼痛、肿胀等症状。在治疗风湿痹痛时，可与川乌、草乌同用，可以使用酒精浸泡外涂疼痛部位，或与全蝎、蜈蚣等搭配治疗关节炎及骨髓炎。而治疗牙痛时，可搭配细辛水煎漱口用。治疗风疹瘙痒时，常与蝉衣同用。
对于孕妇禁用，蜂窝含有的一些激素或类激素成分，可使孕妇体内激素失衡，甚至可能刺激子宫而引起宫缩，引起流产等不良反应。蜂窝最简单的吃法是直接嚼服，但要注意，蜂巢中可能含有巢虫、蜂螨等寄生虫或卵，故选用时应谨慎。