鼻炎后期咳嗽厉害很有可能与病毒感染、细菌感染、过敏性鼻炎有关，可根据不同病因进行治疗。
1、病毒感染
如果机体抵抗力下降的情况下，反复病毒入侵导致上呼吸道感染，从而出现打喷嚏、流鼻涕、鼻塞等症状。若后期鼻涕过多刺激到咽喉部，就可能会反复地咳嗽。早期的鼻腔病毒感染患者可根据医嘱使用盐酸羟甲唑啉、布地奈德等药物；当继发细菌感染可根据医生指示使用阿莫西林、头孢克肟等药物治疗。
2、细菌感染
细菌性鼻炎是因为细菌入侵机体，而且机体抵抗力较低所以出现了鼻腔的炎症细菌感染引起的鼻炎可能会出现鼻子的瘙痒疼痛或者打喷嚏、流鼻涕症状。细菌入侵导致鼻炎的患者，如果后期没有完全治愈或反复感染，可能导致咳嗽症状的发生。细菌感染引起鼻炎可遵医嘱应用青霉素、甲氧西林、氯唑西林等药物治疗。必要时，可通过选择性神经切断术、鼻腔缩窄术等手术方式进行治疗。
3、过敏性鼻炎
过敏性鼻炎是一种由基因与环境相互作用而诱发的多因素疾病，常与接触过敏原有关。发病期间鼻腔分泌物增多，经鼻后道返回咽部，会刺激咽部黏膜出现咳嗽症状。症状较轻过敏性鼻炎患者可根据医嘱使用布地奈德、丙酸氟替卡松、氮卓斯汀等药物进行治疗；药物治疗无效的过敏性鼻炎患者可使用手术治疗，如筛前神经截断术、鼻后神经截断术等。
此外，鼻炎后期咳嗽厉害还可能是并发咽炎等引起，应及时前往医院就诊，在医师指导下，明确原因后给予针对性规范用药和治疗，不可自行用药。