睡觉时的心率40次/分钟-50次/分钟多考虑是生理性窦性心动过缓引起的，也不排除是病理性窦性心动过缓。心肌炎等引起的。可根据病因选择合适的治疗方式。
1、生理性窦性心动过缓
若患者是年轻的运动员或体力劳动者，可能会出现生理性窦性心动过缓，因此睡觉时的心率40次/分钟-50次/分钟可能是正常现象。若没有不适症状，一般无需治疗。但是要时刻观察病情，若出现不适症状，应立即到正规医院进行相关检查。
2、病理性窦性心动过缓
若患有脑膜炎、脑肿瘤等疾病，可能会引起颅内压升高，导致迷走神经中枢兴奋性增高，从而会引起病理性窦性心动过缓，晚上睡觉时可能会出现气短、乏力、胸闷等症状。可给予吸氧治疗缓解不适症状，也可到正规医院注射硫酸阿托品注射液、盐酸异丙肾上腺素注射液等药物提高心率。
3、心肌炎
若受到细菌、真菌等病原体的感染可能会引起心肌炎，可能会出现心悸、胸闷、气短等症状，部分患者会有心律不齐的症状。患者应卧床休息，避免情绪激动或者剧烈运动。也可到正规医院静脉滴注磷酸肌酸钠注射液，遵医嘱口服辅酶Q10软胶囊等药物改善心肌能量代谢。
除此之外,睡觉时的心率睡觉时的心率40次/分钟-50次/分钟也不排除是心包炎、心脏病等引起的。建议到正规医院进行相关检查，明确病因再进行治疗。