巧囊和试管在医学上通常是指巧克力囊肿和试管婴儿。巧克力囊肿4cm一般是可以做试管婴儿的，但是建议将巧克力囊肿治疗后再进行试管婴儿。
巧克力囊肿主要是指女性的卵巢部位出现类似巧克力状的囊肿组织，是比较严重的，没有及时有效治疗体系，可能会有所增长，从而影响到正常的受孕，也可能会引起急腹症、盆腹腔广泛粘连等并发症。如果出现巧克力囊肿4cm想要进行试管婴儿，可以先将巧克力囊肿进行全面清除，等到女性身体恢复后再进行试管婴儿，一般不会对女性身体健康造成太大影响，而且还可以避免在胚胎移植后出现腹部不适等症状。
如果出现巧克力囊肿4cm，可以配合医生服用孕激素类药物进行治疗，如醋酸甲羟孕酮、甲地孕酮等药物治疗。若药物改善效果不佳，还可采取手术治疗。