喉咙里面长水泡多考虑上呼吸道感染引起的，也可能由于胃食道反流、疱疹性咽峡炎等疾病引起的。
1、上呼吸道感染
上呼吸道感染多数为患者受凉、气候突变、过度劳累等因素造成呼吸道局部防御功能降低，诱发上呼吸道感染。上呼吸道受到病原体感染时，咽喉部位会出现炎症反应，咽喉黏膜受到炎症持续刺激，就会出现充血水肿表现为喉咙里面长泡的现象，还可伴有喉咙疼痛、咳嗽等不适。若患者不适的症状较轻，可通过多饮水，适当运动等方式来加强新陈代谢，使部分毒素随自身汗液及尿液进行排出体外。但若患者症状较重，应及时在医生的指导下使用阿莫西林、阿昔洛韦片等药物进行治疗。
2、胃食道反流
胃食管反流多为患者胃部消化能力下降，导致胃内食物无法消化分解，内分泌失调产生大量胃酸溶液，胃酸反复刺激咽喉部黏膜可引起黏膜出现充血以及滤泡增生。患者主要表现为咽喉部异物感、咽干、咽痒、咽部有分泌物、出现咳嗽等症状。若患者症状较轻，通常情况下可通过调整饮食习惯来缓解。但若患者症状较明显，一般可在医生的指导下使用甘桔冰梅片、蒲地蓝口服液等药物进行治疗。
3、疱疹性咽峡炎
疱疹性咽峡炎是由柯萨奇A组病毒引起的，以急性发热和咽峡部疱疹为主要临床特征的传染性疾病。夏秋季常见，临床上患儿常表现为高热、流口水，偶有症状严重的患儿会出现呕吐、抽搐等表现。还会导致咽喉部出现红肿，口腔内壁、牙龈等部位出现数个大小不等的灰白色疱疹混杂着溃疡。若患者症状较轻，可通过日常饮用金银花水、桔梗水、薄荷水、胖大海水等进行缓解。
若患者自身患有鼻后滴漏综合征、慢性咽炎等疾病也会导致喉咙里面长泡，在病因不明的情况下，需及时就诊查明病因并对症治疗。