囊肿一般不会自行消失，需要配合治疗。患者需要根据囊肿的类型进行相应治疗，避免病情恶化，比如肝囊肿、肾囊肿、卵巢囊肿等。
1、肝囊肿
肝囊肿是肝脏上出现单个或多个囊性肿块，通常是由于寄生虫感染、外伤等原因所引起，主要表现为右上腹疼痛、腹胀、急性胆绞痛等。此类患者可以在医生指导下使用吡喹酮、氯硝柳胺等抗寄生虫药物治疗，对于病情严重的患者还可以通过手术治疗。
2、肾囊肿
肾囊肿通常是由于遗传畸形、慢性肾脏疾病等原因所引起，主要表现为一侧或双侧腰部疼痛、尿频、血尿等。此类患者通常可以通过手术治疗，比如腹腔镜去顶减压术、腹腔镜下囊肿切除手术、开腹肾切除术等。
3、卵巢囊肿
卵巢囊肿通常是指由于内分泌紊乱、长期炎症刺激等原因所引起的异常肿大，主要症状为下腹部不适、月经紊乱、腹痛等。此类患者通常可以使用头孢曲松、头孢哌酮、左氧氟沙星等药物进行治疗，或通过卵巢囊肿切除术、输卵管卵巢切除术等手术治疗。