咽口水喉咙有咯噔声多考虑为生理性因素，还可能是患有喉咙炎或急性扁桃体炎等疾病引起。应及时去医院进行相应的检查，并在医生的诊断下进行相应的治疗。
1、生理性因素
在做咽口水的动作时，喉咙部位的软骨会随着运动，可能会有咯噔声出现。这是正常的生理现象，一般无须做特殊治疗，平时应该注意局部的保暖，改善症状，日常要注意多饮水。
2、喉咙炎
都是由于自身免疫力比较低弱，存在细菌或病毒感染，诱发喉咙炎，炎症会刺激喉咙，在做咽口水的动作时，可能会有声音并伴有疼痛。可以遵医嘱服用碘含片或银黄含片等药物进行治疗，同时要多喝温水，可有助于促进病情的恢复。
3、急性扁桃体炎
急性扁桃体炎多是由流感病毒或乙型溶血性链球菌感染引起，除了喝水时喉咙有咯噔声，还可能会伴有喉咙肿痛、发热等症状。可以在医生的指导下注射头孢硫脒注射液或阿奇霉素注射剂等药物，控制病情发展，还可以通过扁桃体剥离术进行手术治疗。
除了上述因素之外，还可能与咽鼓管炎、喉软骨炎等疾病有关。需要去医院就诊，根据具体的病因对症治疗。