停用益生菌后便秘可能是饮食习惯、药物以及胃肠功能紊乱引起的，需根据具体原因进行治疗。
1、饮食习惯
停用益生菌后若食用过多高盐、高脂、高糖类的食物，可能会导致出现大便燥结、排便困难等便秘症状。可通过腹部按摩、艾灸等物理治疗方式缓解症状。生活中应当多吃新鲜的水果蔬菜，多吃易于消化的食物，有助于病情的恢复。
2、药物
若因身体其他疾病，在停止服用益生菌药物后，服用抗抑郁药，如马来酸氟伏沙明片、盐酸帕罗西汀片等，或者服用钙通道拮抗剂类药物如硝苯地平缓释片、苯磺酸氨氯地平片等，这些药物可能会导致出现便秘的症状。若便秘的症状比较严重，应及时去医院咨询医生，及时的换药、停药，以免病情加重。平时，患者可多吃富含膳食纤维的食物，如菠菜、韭菜等，少吃油腻、过甜的食物，有利于病情的恢复。
3、胃肠功能紊乱
若停止服用益生菌药物后，熬夜、精神压力较大以及抽烟酗酒，可导致胃肠功能紊乱。因消化功能减弱，伴随着便秘、腹痛等症状。患者可遵医嘱使用多潘立酮片、西沙必利片等药物促进胃肠道蠕动，或者在医生指导下使用奥美拉唑肠溶片、半托拉唑肠溶片等抑制胃酸分泌的药物来减少胃酸对黏膜的刺激。
另外，肠道菌群失调症、功能性便秘也可能会引发便秘，此时患者应及时到医院就诊检查，明确病因后进行针对性治疗。