孕39天流血考虑存在先兆流产的情况，也可能是阴道受到感染导致的，需要明确原因后采取对应措施。
1、先兆流产
由于怀孕39天时间比较短，受精卵着床还不稳定，当子宫受到刺激以后会引起宫缩导致先兆流产，从而出现流血的现象。需要及时通过保胎的方法进行改善，可以先采取卧床休息的方法，如果休息两三天以后流血的现象没有得到缓解，可以在医生的指导下使用保胎的药物，比如黄体酮胶囊、保胎丸等。
2、感染
如果平时不注意个人卫生，容易使阴道受到细菌感染，出现孕39天流血的现象。由于女性怀孕属于特殊时期，不建议使用药物进行治疗，可以采取温水清洗的方法进行改善，清洗完以后要及时更换内裤。