半小时发热39℃，可能是上呼吸道感染、扁桃体炎、系统性红斑狼疮等疾病所导致的，可以根据引起的原因进行治疗。
1、上呼吸道感染
如果不注意保暖，受凉后抵抗力就比较低下，容易受到病菌的入侵，从而引起上呼吸道感染。可能会出现咳嗽、咳痰、鼻塞等情况，甚至还会伴有发高热的情况，从而出现在半小时内发热达39℃的情况。可以遵医嘱使用风寒感冒颗粒、感冒清热颗粒等药物进行治疗。
2、扁桃体炎
扁桃体部位受到细菌的感染所引起的，会出现扁桃体肿大、声音嘶哑、咽喉疼痛等不适现象。如果没有得到及时的治疗，会使体内的白细胞迅速升高，也会引起上述现象。可以遵医嘱使用抗生素药物进行治疗，比如阿莫西林胶囊、罗红霉素胶囊。
3、系统性红斑狼疮
这属于一种免疫系统方面的疾病，会出现有高热反应的情况，甚至会伴有体重下降和疲劳乏力的症状，所以会出现在半小时内发热达39℃的情况。可以遵医嘱使用糖皮质激素类的药物进行治疗，比如地塞米松注射液、甲泼尼龙片等。