孕期有褐色分泌物怎么办需要根据具体原因分析，可能是先兆流产、异位妊娠等因素导致的。
1、先兆流产
怀孕以后如果不注意休息，进行重体力劳动，可能会引发先兆流产，出现阴道少量流血的症状，导致孕期有褐色分泌物的现象。可以通过卧床休息的方法进行改善，必要时在医生的指导下使用黄体酮胶囊、保胎丸等药物进行保胎治疗。
2、异位妊娠
孕期有褐色分泌物也可能是异位妊娠导致的，异位妊娠是指受精卵在子宫体腔以外的部位着床，会出现停经、阴道出血、腹痛等症状，可导致孕期出现褐色分泌物。确诊后需要遵医嘱使用甲氨蝶呤终止妊娠，必要时需进行保守手术或根治手术。