一般情况下，藿香正气水和藿香正气胶囊的功效主治是一样的。
藿香正气水和藿香正气胶囊属于中成药物，为一类药物，不过藿香正气水和藿香正气胶囊的剂型是不同的。两种药物的成分是相同的，是由陈皮、白芷、茯苓等中药材制作而成。有解表化湿、理气和中的功效，通常可以用来改善外感风寒、内伤湿滞、夏伤暑湿所致的感冒、胃肠型感冒等。
所以藿香正气水或者是藿香正气胶囊功能主治是一样的，都可以达到缓解病情的目的，并不会损伤到肠胃组织以及脾胃。但是藿香正气水中含有一定浓度的酒精，一般建议对酒精过敏者、开车者选择藿香正气胶囊，在服用药物过程中要遵医嘱，不可盲目用药。而且该药物服用后可能会出现不适症状，比如呕吐、头晕、面部潮红等，要多注意卧床休息。