蹲时间长了腰疼可能跟长时间保持一个姿势、肌肉劳损、腰椎间盘突出症等因素有关，可以根据病因积极的进行治疗。
1、长时间保持一个姿势
如果长时间保持蹲着的姿势，可能会导致局部的肌肉长时间处于紧绷的状态，容易出现痉挛的情况，导致腰部疼痛，此时需要适当的调整姿势，也可以通过推拿、热敷的方式来缓解。
2、肌肉劳损
蹲的时间长了可能会导致腰部的肌肉受到损伤，容易引发炎症性的病变，通常会伴随明显的腰疼症状，还有可能会导致腿麻。患者可以遵医嘱使用盐酸乙哌立松片、氯唑沙宗片等药物进行治疗，能够起到松弛肌肉的效果。
3、腰椎间盘突出症
腰椎间盘突出症属于退行性的病变，如果长时间的蹲着、长时间做劳累的体力活，便有可能会导致腰部的关节受到损伤，容易出现腰疼、腿麻、肢体无力等症状。患者可以通过牵引治疗的方式来改善，也可以使用神经根减压手术进行治疗。