眼睛上有透明水泡，可能是细菌性结膜炎、过敏性结膜炎等原因所导致的，可以通过药物治疗、手术治疗的方式进行改善。
1、细菌性结膜炎
结膜部位受到细菌感染所引起的，通常会出现有白色分泌物、眼睛疼痛、眼睛上有透明水泡等症状。可以遵医嘱使用抗生素类的药物进行消炎治疗，比如盐酸左氧氟沙星滴眼液、妥布霉素滴眼液等药物。若出现脓肿的情况下，可以通过手术切开排脓的方式进行治疗。
2、过敏性结膜炎
眼睛部位受到过敏原的入侵所造成的，通常会使患者表现为眼睛上有透明水泡、眼睛瘙痒、视力下降等情况。可以遵医嘱使用抗过敏的药物进行治疗，比如氯雷他定胶囊、马来酸氯苯那敏片等，也可使用地塞米松磷酸钠滴眼液治疗。