黄色的眼屎是指眼睛分泌黄色的分泌物，通常情况下这是由于细菌感染引起的症状，所以早上起来眼睛有黄色的眼屎，可能是由于患有细菌性结膜炎、角膜炎、泪囊炎等炎症引起的症状，常通过药物进行治疗。
1、细菌性结膜炎
通常是由于手部不洁净揉眼、汗液等方式使得各种细菌进入结膜导致细菌大量繁殖所引起的疾病，可能会出现眼部发红、流泪、分泌黄色分泌物增多等症状。一般通过药物进行治疗，应当在医生的指导下使用盐酸左氧氟沙星滴眼液治疗，感染严重时也可服用阿莫西林胶囊、头孢拉定胶囊等抗感染药物治疗。
2、细菌性角膜炎
通常是由于某些细菌进入到眼睛的角膜内大量繁殖进而引发感染，或者是由于角膜的上皮细胞出现损伤，从而引起细菌繁殖，所引起的疾病，可能会出现畏光、流泪、分泌黄色分泌物增多等症状。应当在医生的指导下使用氧氟沙星眼膏、妥布霉素眼膏等抗感染的药物治疗。眼屎太多时可用生理盐水冲洗。
3、细菌性泪囊炎
通常是由于泪小管、鼻小管出现阻塞导致泪囊中的细菌刺激其黏膜，从而引发的炎症，可能会出现眼部充血、分泌黄色分泌物增多等症状。应遵医嘱使用妥布霉素滴眼液、左氧氟沙星滴眼液等抗感染药物缓解症状。出现脓肿时需要切开引流。