早上喝咖啡肚子不舒服，可能是饮用咖啡过多、腹部受凉、慢性胃炎等原因所导致的，可以通过一般治疗、物理治疗、药物治疗等方式进行改善。
1、饮用咖啡过多
由于咖啡中含有大量的刺激性成分，饮用过多以后会刺激到胃肠道黏膜，从而出现早上喝咖啡肚子不舒服的现象，但是不会出现其他不适症状。建议患者需要避免饮用咖啡，可以通过适当饮用温水的方式改善不适症状。
2、腹部受凉
如果在平时不注意腹部的保暖工作，可能会刺激到腹部，引起早上喝咖啡肚子不舒服的现象。建议可以通过热毛巾热敷腹部的方式进行缓解，也可以适当的喝红糖水进行改善。
3、慢性胃炎
咖啡会刺激胃肠道黏膜，如果患者患有慢性胃炎，可能会加重胃黏膜损伤的情况，从而出现胃胀气、胃疼等症状，患者可能会表现为早上喝咖啡肚子不舒服的情况。建议患者可以遵医嘱使用奥美拉唑肠溶胶囊、枸橼酸莫沙必利片等药物进行治疗。同时，患者也可以通过按摩腹部的方式改善不适症状。