益生菌跟阿莫西林间隔2小时左右再服用。因为益生菌属于一种活菌制剂，而阿莫西林属于一种抗炎药物，如果二者使用的时间比较短，会导致益生菌的效果出现降低，甚至还会导致体内菌群紊乱的情况发生。
益生菌能合成消化酶促进肠道对营养物质吸收、消除或者是降低致病菌黏附，同时能保持肠道菌群结构平衡并改善便秘和腹泻状况，部分患者服用益生菌可发生过敏现象，如恶心、呕吐或荨麻疹，也可发生肠道菌群感染，益生菌不宜与鞣酸、铋剂、活性炭一起使用，以免出现不良反应。
阿莫西林是广谱青霉素类抗生素，临床上主要适用于中耳炎、鼻窦炎或者是扁桃体炎等，部分患者在使用该药物后会出现腹泻、恶心、腹痛或者是皮疹等不良反应。患者在使用阿莫西林时，需要注意饮食清淡，避免食用辛辣刺激性食物，例如辣椒、芥末或者是烤肉等，还需避免饮用刺激性饮品，例如咖啡、酒精，还可通过适当地运动，例如慢走、爬山等。