不存在呋喃西林和碘伏哪个消毒好的说法，呋喃西林和碘伏消毒都比较好，患者可以遵医嘱选择合适的药物进行消毒。
呋喃西林是一种消毒防腐药，主要是对多种革兰阳性和阴性菌有作用，在临床可以用于治疗创伤、烧伤、化脓性皮炎、阴道炎、膀胱冲洗等疾病，对于呋喃类药物过敏者应禁止使用。碘伏具有广谱杀菌作用，可以用于皮肤、黏膜、烫伤、滴虫性阴道炎、皮肤霉菌感染等疾病的消毒，在临床通常适用于皮肤消毒手术部位消毒以及手术前刷手消毒，正常使用会对黏膜有一定的刺激性，但是不会对身体造成影响。所以两种药物消毒都比较好，患者可以在医生的指导下选择药物进行治疗。
使用药物治疗期间，患者应避免接触眼睛等部位，也要关注使用后的情况，避免出现其他的症状。