HPV低级别鳞状上皮内病变是否会自愈需要根据具体情况判断，如果患者症状比较轻，且未出现其他不适反应，则能够自愈，但如果患者症状比较严重，且恢复较差，则不会自愈。
HPV低级别鳞状上皮内病变的患者可选择抗生素药物进行治疗，例如阿莫西林或者是罗红霉素等，能够起到抗炎、抗感染的情况，如果患者炎性比较严重，还需采取物理进行治疗，例如红外线疗法、液氮冷冻疗法或者是电灼等，以上方式对身体的创伤小，预后比较好，但是部分患者在治疗后会影响到妊娠情况，所以需要在医生的指导下进行，需要避免自行选择。如果患者病情比较严重还需及时采取手术进行治疗，例如宫颈环状电切术、宫颈锥形切除术等，能够改善其出现的症状，对于有恶变倾向的患者还需遵医嘱选择化疗药物进行治疗，例如顺铂加氟尿嘧啶，以上药物配合能够降低复发的情况。
患者在生活中还需注意饮食以清淡为主，避免食用辛辣刺激性食物，例如辣椒、花椒或者是芥末等，以免导致病情加重，还可进行适当的运动，例如慢走、快走或者是打太极等，能够提高自身免疫力。