耳朵飞进小飞虫是否能自行排出来，需要根据具体情况进行判断。
1、耳朵飞进小飞虫能自行排出来
如果耳朵飞进小飞虫，进入的位置比较浅，飞虫比较小，可通过轻微的摇动头部，可能会自行飞出。也可以用食指摁住耳庭，导致飞虫在耳朵内会出现缺氧，拼命往外耳道口飞，此时把食指松开，飞虫可自行飞出。如果不能自行飞出，也可以使用手电筒照射耳孔促进蚊子自行排出。
2、耳朵飞进小飞虫不能自行排出来
如果耳朵飞进小飞虫，进入的位置比较深，或者是进入时间比较长，死于耳道内，则不能自行排出来。此时患者可及时到医院的耳鼻喉科就诊，通过耳内镜检查判断飞虫所处的具体位置，由专业的医生使用专业的工具将其取出，可以用枪状镊或是吸引器将虫子取出。
由于虫子本身带有多种细菌或病毒，如果不能及时排出来，部分微生物在耳道内进行繁殖，可导致耳道炎症，引起鼓膜穿孔、耳道感染以及耳道损伤、出血等情况。耳朵飞进小飞虫取出后，注意保持外耳道清洁、干燥和卫生。