一般情况下，患者遵医嘱服用肠道益生菌通常没有明显副作用，但患者若自己乱服药，可能会引起腹痛、便秘等肠道菌群失调的情况。
肠道益生菌主要包括乳酸杆菌、双歧杆菌、酵母菌等，具有调理肠道菌群平衡的作用。患者在医生指导下服用肠道益生菌，有助于促进肠道对营养物质的吸收，从而达到提高机体免疫力的作用，同时还可以抑制肠道炎症的发生。但如果患者不规范用药，可能会因用药不当导致肠道菌群失调，从而引起腹痛、便秘等不适症状。
因此，建议患者需要严格按照医嘱服用肠道益生菌进行治疗，以免因用药不当引起不适症状。同时在用药时建议患者需要使用温度在35℃以下的温水冲服药物，以免导致益生菌失去活性，影响药效。还需要注意的是，益生菌不建议与抗生素同服，如有需要进行联合用药治疗，两种药物需要间隔至少半小时。