更年期通常是指围绝经期综合征，而围绝经期综合征导致的胃肠功能紊乱是否能够自愈一般要根据其严重程度来判断，不可一概而论，通常可分为轻度胃肠功能紊乱、重度胃肠功能紊乱等。
1、轻度胃肠功能紊乱
若围绝经期综合征患者仅为轻度胃肠功能紊乱，大多情况下可以自愈，但患者在此期间应注意饮食，可选择多吃新鲜的蔬菜和水果，例如黄瓜、白菜以及苹果等，避免食用过于辛辣、油腻以及生冷的刺激性食物，例如麻辣烫、肥肉或者是冰淇淋等。
2、重度胃肠功能紊乱
如果围绝经期综合征患者胃肠功能紊乱的情况较为严重，则一般无法自愈，患者需在医生的指导下使用促胃动力药、抑酸药等进行治疗，常用促胃动力药包括多潘立酮、莫沙必利、伊托必利等，而抑酸药包括奥美拉唑、雷贝拉唑等。另外，若患者还伴有较为严重的腹泻症状，还需遵医嘱服用止泻药，例如洛哌丁胺、蒙脱石散等。建议患者在医生指导下用药，不可私自更改服药剂量，以免引起便秘、腹胀等不良反应。