椎间孔镜术后40天还是有症状可能是因为神经根或脊髓损伤严重、手术没有清除完全等导致。根据引起的原因不同，治疗方法也不同。
1、神经根或脊髓损伤严重
椎间盘退行性变后发生椎间盘突出，行椎间孔镜手术后腿部仍有疼痛，很可能是因为髓核突出压迫神经根或脊髓时间较长，产生了较为严重的神经、脊髓的损伤，做完手术后，短时间内无法恢复到正常状态，局部血液循环不畅。患者可以遵医嘱服用美洛昔康、塞来昔布、布洛芬、双氯芬酸钠等非甾体类抗炎药，进行止痛、抗炎治疗；也可以选择甲钴胺、呋喃硫胺等神经营养药物，促进神经细胞的修复。
2、手术没有清除完全
也有可能是手术没有完全清除破裂的椎间盘和髓核，仍有部分组织残余压迫神经根，表现为腿部的疼痛感。患者可以选择局部按摩、热敷等物理方法，促进局部血液循环、改善新陈代谢，从而缓解局部疼痛、肿胀等症状。必要时可再次进行手术探查，解除神经压迫，从而改善疼痛等症状。