碘伏擦伤口一般并不会导致疼痛或疼痛很轻微，如果出现疼痛剧烈，考虑是伤口本身的疼痛，并不是碘伏导致的。
碘伏是一种具有抗菌作用的消毒制剂，其对伤口没有明显的刺激症状，刺激性不强，所以患者一般只会感觉到轻微的不适感，疼痛感并不强烈。在临床上，碘伏常做杀菌消毒剂，可用于皮肤黏膜的消毒，也可用于创伤，还可用于辅助治疗滴虫性阴道炎、皮肤霉菌感染等。
如果是深度伤口，医生有时会将碘伏用生理盐水稀释后冲洗伤口，这样有利于伤口的愈合。伤口清创时，除碘伏外，还可应用双氧水等消毒制剂，因为双氧水对清除厌氧细菌有很好的杀灭效果，特别是对破伤风杆菌。