移植的优质囊胚不着床，其原因众多，一般多是胚胎遗传物质异常、母体健康状态影响等原因造成的。
1.胚胎遗传物质异常
优质囊胚是指胚胎发育形态良好，细胞数量与发育时间相匹配的胚胎，移植优质胚胎可以增加移植的成功概率。但优质胚胎也有可能存在染色体畸变、 DNA变异等基因遗传物质的异常，从而使胚胎着床失败，即使是优质胚胎，也有可能发生不着床、移植失败的情况。
2.母体健康状态影响
母体子宫存在宫腔粘连、息肉、黏膜下子宫肌瘤、子宫内膜炎、子宫内膜薄等病症时，都会导致胚胎着床的概率下降；如果母体的输卵管有炎症分泌物，也会对已着床的胚胎产生影响，使其脱落从而造成流产现象；在怀孕期间，若母体的免疫系统发生异常，则会引起子宫内膜对胚胎产生排斥，导致着床失败。胚胎着床还取决于子宫内膜的血供情况，如果胚胎的营养供应不足时，也会在一定程度上影响胚胎着床，出现流产的现象。