阿米巴菌的说法不准确，一般是指阿米巴原虫，其主要通过粪口途径、昆虫传播等方式感染。阿米巴原虫是一种寄生虫，主要有滋养体和包囊等两种形态，一般由包囊进行传播。感染人体后可导致阿米巴原虫病、阿米巴肠病等，临床主要表现为腹痛、腹泻、腹胀、里急后重，还可出现大便带血和黏液，多呈暗红色或紫红色，糊状，具有腥臭味等。
1、粪口途径
粪便中持续带包囊的包囊携带者是阿米巴菌的主要传染源，包囊的抵抗力较强，在适当温度、湿度下可生长数周，并保持较强的感染力。人体感染阿米巴原虫的主要途径是粪口感染，例如，食用含有成熟包囊的粪便污染过的食品、饮水或使用污染的餐具等均可感染。所以日常生活中应注意养成良好的用餐习惯，饭前便后洗手，避免食用不洁的食物。
2、昆虫传播
因为包囊在经蝇类或蟑螂等昆虫的消化道后仍具有感染性，昆虫在接触包囊携带者的粪便后，可通过体表携带或呕吐排便方式传播，当这些媒介昆虫爬过或者停留在食物上就可能会污染食物，食用该食物后可引起人体感染。
阿米巴原虫感染人体后，一般可通过粪便检查、阿米巴培养、组织检查等方法确诊。治疗上，一般建议患者注意休息，尽量进食流质或半流质的高蛋白饮食。还可遵医嘱进行病原治疗，例如，遵医嘱选择服用二氯尼特等药物进行治疗。