肚子疼上厕所次数多，可能是由肠道菌群失调症、急性胃肠炎等原因所引起，建议患者根据不同的病因采取相应的治疗措施。
1、肠道菌群失调症
肠道菌群失调主要是由于药物、饮食等原因导致肠道菌群变化而引起失衡的状态。临床上可表现为腹痛、大便次数增多、呕吐等症状，部分患者可能会出现肚子疼上厕所次数多的情况。建议患者可在医生指导下使用双岐三联活菌胶囊、酪酸梭菌肠球菌三联活菌散等益生菌制剂，调节肠道菌群，以达到治疗目的。同时对于排便次数增多的患者，可遵医嘱配合使用蒙脱石散、盐酸洛哌丁胺等药物进行止泻治疗。
2、急性胃肠炎
急性胃肠炎主要是由于进食被污染食物后，食物中携带的细菌、病毒会在肠道内产生大量的毒素，导致胃肠道黏膜出现充血、水肿的炎症反应。临床上一般出现腹痛、腹泻、呕吐等症状，患者可能会表现为肚子疼上厕所次数多的情况。建议患者可遵医嘱使用诺氟沙星、环丙沙星、左氧氟沙星等进行抗感染治疗，对于腹痛症状明显的患者，可以在医生指导下配合使用阿托品、消旋山莨菪碱等药物解除胃肠道痉挛，缓解腹痛的症状。