已经杀过牙神经的牙做根管治疗一般不会疼，杀牙神经是使牙髓失去活力，此时是不会感觉到疼痛的。如果杀过神经后还出现疼痛，可能是操作后刺激组织、根管预备、炎症未消除或者是其他部位引起的疼痛。
1.操作后刺激组织
根管内的牙髓组织具有痛觉感受器，当牙髓炎时牙髓还有活力，放入牙髓失活剂时，药物会引起牙髓充血、变性，使其失去活力不能感受疼痛。但是牙髓失活剂也可能会刺激导致牙痛，疼痛严重的情况下需要到医院就诊。
2.根管预备
牙髓失去活力后需要对根管进行预备，用器械清除根管内壁坏死的牙髓组织和感染性物质，过程中在根管内进行操作不会感到疼痛。但有可能进行冲洗时将牙本质碎屑和药物冲出根尖孔，引起操作过后轻微的疼痛，但疼痛为暂时的，一般可自行缓解。
3.炎症未消除
对于慢性根尖炎牙髓坏死的患牙，因为炎症难以短时间内完全消除，所以会产生咬合痛的症状，应及时就诊，定期观察。
4.其他部位引起的疼痛
可能出现其他疾病引起牙齿疼痛，如三叉神经痛，患者难以鉴别疼痛位置，会误认为是该治疗的牙齿疼痛，建议到医院检查，查明原因及时处理。