杀牙神经后晚上疼痛难忍，可能是因为牙髓未完全失活、牙髓炎症发展到根尖区或其他口腔疾病引起，可以先遵医嘱口服消炎药物和止痛药，暂时止痛，第二天及时去医院检查，查明病因，对症治疗。
1.牙髓未完全失活
患牙在治疗期间，可能有牙髓未完全失活，有炎症的牙髓会导致疼痛出现，主要的症状是出现不能定位的自发性钝痛（如夜间睡觉时疼痛），对冷热刺激敏感，在这种情况下需要及时就诊，并在医生指导下服用消炎药物，或再次进行根管处理。
2.牙髓炎症发展到根尖区
当牙髓炎症发展到根尖区时，会引起根尖区骨质发生炎症，并造成疼痛，主要症状是触碰患牙时疼痛和咀嚼痛（咬合痛），炎症严重时会导致牙龈红肿，面部肿胀，这种情况应继续完善根管治疗。
3.其他口腔疾病
牙痛可能是食物嵌塞造成牙间乳头炎，或者牙劈裂、牙齿咬合关系紊乱造成的咬合创伤等原因引起，如果疼痛严重，需及时就诊，由医生分析原因进行相应处理。
此外，还可能是一些表现为牙痛但实际非牙源性的疼痛，如三叉神经痛、颞下颌关节功能紊乱、上颌窦炎等，以上疾病建议做专业的检查，才能鉴别、诊断和进一步治疗。