先天性梅毒一般需结合病史、临床表现、X线检查、银染色等，由专业的医生明确诊断，不可自行诊断。先天性梅毒主要是梅毒螺旋体由母体经胎盘进入胎儿血循环所致的感染。
1、病史
应详细询问患儿父母，尤其母亲有无性病史、梅毒检验史及治疗史。如有怀疑，母亲应做梅毒血清学试验。如母亲梅毒血清学试验阳性，婴儿受感染可能较大。
2、临床表现
新生儿期症状常不明显，故早期诊断较困难。先天性梅毒患儿出生后出现肝脾和全身淋巴结肿大、出现皮肤和黏膜损害以及骨损害，血液系统出现贫血、血细胞减少的情况。
3、X线检查
对于早期无症状性的新生儿的诊断具有较大价值，在常规X线检查中，可见长骨干骺端炎，长骨干骺端边缘会有锯齿状的骨质破坏表现。这种骨质破坏，与梅毒螺旋体有一定关系，通过此类检查，可进一步验证患儿体内是否存在梅毒螺旋体。
4、银染色
先天性梅毒也可用银染色法检查梅毒螺旋体。银染色一般是将皮损部位取出进行镀银染色，在暗视野显微镜下检查梅毒螺旋体，也是检测梅毒螺旋体最直观的方法。
先天性梅毒的患儿可遵医嘱使用苄星青霉素、普鲁卡因青霉素等药物进行治疗。另外，患儿的衣物、被服等应严格消毒，以免引起交叉感染。同时，要加强患儿皮肤、口腔护理，保持皮肤清洁。