黑附子的疗效一般有温通经络、散寒止痛、补火助阳以及回阳救逆的疗效。
1、温通经络 散寒止痛
黑附子具有温通经络、止痛散寒的功效，临床通常用于治疗骨结疼痛、肢冷脉微、寒湿痹痛或者是恶寒吐泻等病症，也用于治疗头痛、胃寒冷痛或者是脘腹冷痛等症状。一般患者在使用黑附子时，需要遵医嘱配合桂枝以及白术等药材一起配伍使用，可以达到较好的治疗效果。
2、补火助阳
可用于治疗肾阳不足导致畏寒肢冷、阳痿、尿频等病症，同时多配伍肉桂、熟地、菟丝子、山萸肉等药材同用。也可用于治疗脾阳不振导致脘腹冷痛、大便溏泄等病症，一般配合党参、白术、干姜、炙甘草等药材同用。
3、回阳救逆
黑附子具有补肾阳以及益心阳的作用，能够用于治疗因肾阳和心阳脱虛正常的气喘、心悸或者是大汗淋漓等症状，能够单独应用，但药效一般，所以常与人参、甘草、干姜等一起配伍使用，以加强回阳救逆的功效。
黑附子需要避免与犀角、夏瓜蒌以及白芨等中药一同食用，因为犀角、夏瓜蒌以及白芨等中药与附子药性相反，一同使用会增强附子的毒性，从而损害机体。同时附子性大热，高热或者是阳气过盛者服用后可能会助阳生火，使病情加重，所以建议高热或者是阳气过盛者需要避免服用黑附子。