肠炎药物选择，需根据不同病因选择不同药物进行治疗。肠炎包括感染性肠病及非感染性肠炎。
1、感染性肠炎
细菌、病毒、真菌等感染性因素可诱发感染性肠炎，感染性肠炎的症状比较轻微，只限于肠道，肠炎腹痛多在左下腹部，表现为便前腹痛，便后缓解。腹泻的症状可是稀水样便，也可是糊状，有时会出现十几次，严重还会影响到胃。这种情况，患者可遵医嘱使用喹诺酮类抗生素进行治疗，比如诺氟沙星、氧氟沙星、硫酸庆大霉素等药物。
2、非感染性肠炎
非感染性肠炎一般是由于患者过量进食有刺激性且不易消化的食物等引起。其主要表现是消化不良、食欲减退、呕吐、大便次数多，但大便次数较少，颜色多为淡水或水、黄色或黄绿色，多见于乳白色或黄色乳瓣，无泡沫或脱水。对于非感染性肠炎的患者可遵医嘱口服一些益生菌类药物，如枯草杆菌二联活菌、双歧杆菌、酪酸梭菌等，对于有严重腹泻的人可口服止泻药如蒙脱石散等。若患者出现剧烈呕吐不能进食或腹泻频繁，应遵医嘱使用葡萄糖盐水静脉滴注。