胃镜伤害的大小取决于胃镜的具体操作方式，根据胃镜的操作方式可分为普通胃镜、组织活检或内镜治疗、无痛胃镜。
1、普通胃镜
单纯胃镜检查一般仅需5-10分钟，很少会对胃部黏膜造成损伤，因此对人体基本没有伤害，少数患者会出现不同程度的恶心、腹胀等症状。通常检查结束后症状会缓解，无需特殊治疗。
2、组织活检
如果需要行组织活检或内镜下治疗，如息肉切除、黏膜下切除等，会对胃粘膜造成伤害，有可能造成出血、穿孔，严重的会造成失血性休克和弥漫性腹膜炎，甚至危及生命。组织活检后的患者应该观察是否出现腹胀、腹痛、呕血、黑便等症状，一旦出现这些症状，应该及时就医。
3、无痛胃镜
无痛胃镜需要使用镇静或麻醉药，可能会出现呕吐、窒息等麻醉风险，严重的还会引起缺氧性脑病，可能对身体造成伤害。无痛胃镜过程中，应该备好急救物品，并且进行心率、血压监测，防止意外发生。
为减少胃镜风险，患者应严格注意胃镜前后的要求。胃镜前6-8小时要禁食和禁水。普通胃镜检查结束后半小时内不要喝水、进食，以免误入气管引起呛咳或发生吸入性肺炎。如果检查中需要取病理活检或钳除息肉治疗，术后2小时后进食温凉流质饮食，如米汤、菜汤等，并禁止吸烟、饮酒、喝浓茶和浓咖啡，以减少对胃黏膜创面的刺激。检查后患者咽部可能会有疼痛或异物感，或出现声音嘶哑，一般3-5天内会好转。检查后24小时内不可做剧烈运动，应结合身体的实际情况适当休息，不可进行驾车、攀爬等活动。检查后的3天要注意观察一下大便的颜色是否正常，如果有出现柏油样黑便，应立即就医。