呼气试验一般要空腹。在空腹的状态下服下尿素，可以使碳13或者碳14很好与幽门螺杆菌产生的尿素酶发生反应，能比较准确反映胃内是否存在幽门螺杆菌感染。如果进食之后再检查，易因食物的因素导致尿素不能充分与尿素酶发生反应，进而影响检查结果。根据仪器的不同，空腹时间也有些差异，一般至少需要空腹1小时，有的需要空腹4小时。
呼气试验是检测幽门螺杆菌感染的首选方法，主要是C13、C14尿素呼气试验。通过呼气试验检测幽门螺杆菌时，需要口服含有碳13或者碳14同位素标记的尿素。尿素可以和幽门螺杆菌产生的尿素酶发生反应，然后产生有碳13、碳14标记的二氧化碳。二氧化碳被人体吸收之后经过肺部呼出，这时候检测肺内呼出的碳元素，如果存在有碳13、碳14标记的二氧化碳，就表明体内有幽门螺杆菌感染。检查前不仅要禁食禁水，也不能口服抑酸药或者抗菌素类药物，例如阿莫西林、头孢呋辛、奥美拉唑等。