导致口臭的原因较多，可以是口腔来源，包括食物嵌塞、牙周炎、舌苔等，也可以是其他来源，包括消化系统的幽门螺杆菌感染、消化不良、长期便秘以及呼吸系统疾病等。想要根除口臭，需要寻找口臭的来源，在医生的指导下针对性地使用药物进行治疗。
1.口腔来源
牙周炎、舌苔清洁不良、食物嵌塞等，都会引起口臭。对于患有牙周炎的患者，口内会有厌氧菌的感染、繁殖，产生臭气，对于这一类口臭的人群，在临床医师指导下服用甲硝唑或替硝唑以及前往有资质的口腔诊所或医院进行牙周序列治疗，有助于去除炎症，缓解口臭。此外，舌苔清洁不良以及牙缝的食物嵌塞也是导致口臭的重要原因，患者需要及时清理牙缝中的食物残渣以及做好日常的舌苔清洁，以改善长期口臭。
2.其他来源
幽门螺杆菌感染：幽门螺杆菌的消化道感染，会在胃内代谢产生臭气，臭气上涌就会形成长期的口臭。治疗上在于根除幽门螺杆菌，临床上通常采用四联疗法，效果较好，患者需要在临床医师指导下服用两种不同的抗生素，比如阿莫西林、克拉霉素等，还有一种质子泵抑制剂，如兰索拉唑，以及一种铋剂，如果胶铋。
消化不良：对于长期消化不良的患者而言，由于未完全消化的食物在胃肠道发酵等原因，也可以导致长期口臭，此类患者可以遵医嘱服用乳酸菌素片，能够促进胃肠道蠕动，对治疗消化不良导致的长期口臭效果较好。
长期便秘：如果长期便秘，体内废物无法及时排出，留存时间较长则会产生含有臭味的气体，导致长期口臭。此类患者需要在临床医师指导下服用吗丁啉、莫沙必利等促进胃肠道蠕动的药物，通过帮助排便缓解长期便秘导致的口臭，效果较好。
呼吸系统疾病：当患者罹患呼吸系统疾病（如肺脓肿）时，常出现酸腐味口臭、恶臭。此类患者可以在临床医生指导下服用抗生素对疾病进行治疗，能一定程度上减轻口臭。