核酸疫苗接种方法有肌肉接种、皮下、腹腔内接种、皮肤和呼吸道接种等。
核酸疫苗又称为基因疫苗，是将编码某种抗原蛋白的外源基因直接导入动物体细胞内，并通过宿主细胞的表达系统合成抗原蛋白，诱导宿主产生对该抗原蛋白的免疫应答，以达到预防和治疗疾病的目的。基因疫苗是利用现代生物技术免疫学、生物化学、分子生物学等研制成果，分为DNA疫苗和RNA疫苗两种。但目前对核酸疫苗的研究以DNA疫苗为主。DNA疫苗又称为裸疫苗，因其不需要任何化学载体而得此名。裸疫苗导入宿主体内后，被组织细胞、抗原递呈细胞或其他炎性细胞摄取，并在细胞内表达病原体的蛋白质抗原，通过一系列的反应刺激机体产生细胞免疫和体液免疫。接种后蛋白质在宿主细胞内表达，直接与组织相容性复合物MHCI或II类分子结合，同时引起细胞和体液免疫，对慢性病毒感染性疾病等依赖细胞免疫清除病原的疾病的预防有效。