怀孕36周咳嗽厉害可能是生理因素引起的，也可能是咽炎、支气管炎、肺炎、哮喘等疾病导致的，此时建议及时就医接受治疗，包括一般治疗、药物治疗。
1、生理因素
怀孕36周属于孕晚期，孕晚期时腹压增高，可引起孕妇不自主地咳嗽，如果不伴有鼻塞、流鼻涕、头痛等症状，通常属于正常的生理现象。患者可适量饮用冰糖炖雪梨，对缓解咳嗽有较好的作用，同时还能补充身体所需的维生素、有机酸等营养。另外，孕妇孕晚期身体较虚弱，病菌容易入侵，适量饮用姜糖水也能辅助抵抗病菌，对咳嗽起缓解作用。
2、咽炎
如鼻病毒、冠状病毒、流感病毒、副流感病毒等是咽炎常见病因。这些病毒可通过飞沫传播或接触传播进入人体，感染咽部黏膜细胞，引发炎症反应。咽部黏膜受到炎症刺激，可引起咳嗽反射。咳嗽的性质多样，可为干咳，也可伴有少量白色黏痰，对于急性咽炎患者，应保证充足的休息，多喝水，最好是温水，有助于缓解咽部不适，促进炎症的消退。
3、支气管炎
细菌或病毒感染蔓延至支气管，引发支气管炎，炎症刺激支气管黏膜，可能导致分泌物增多，引起咳嗽。支气管炎引起的咳嗽通常较为持久且剧烈。确诊为支气管炎后，可配合医生使用头孢克肟胶囊、头孢呋辛酯胶囊、头孢克肟颗粒等药物控制炎症，以缓解咳嗽。
4、肺炎
孕期如果感染较为严重，可能发展成肺炎。肺炎时肺部炎症病变广泛，咳嗽往往更为剧烈，伴有咳痰、发热等症状。孕妇一旦怀疑或确诊为肺炎，应立即住院治疗。医生会根据病原体类型选择相应的抗生素进行抗感染治疗，如阿奇霉素片、阿莫西林胶囊、盐酸克林霉素胶囊等。
5、哮喘
孕期哮喘发作也可导致咳嗽。哮喘是一种慢性气道炎症性疾病，接触过敏原、冷空气、刺激性气味等都可能诱发哮喘发作。发作时气道痉挛，引起咳嗽，且咳嗽通常呈阵发性、刺激性干咳，严重时可伴有呼吸困难。孕妇有哮喘病史的，应在孕期规范管理哮喘。避免接触诱发因素，如保持室内清洁、避免花粉以及尘螨等接触过敏原。
孕妇在孕晚期要注意防寒保暖，保证充足的睡眠时间，预防上呼吸道感染的发生。如果剧烈咳嗽无法缓解，或者伴随有发热、宫缩等异常情况时，则需要及时到医院就诊，以免危害孕妇和胎儿的身体健康。