NT检查是否能看出面部畸形需根据面部畸形大小决定。NT检查是指通过B超测量胎儿颈部皮下组织厚度，通常在孕11周~孕13周+6时进行检查。此时胎儿体积比较小，对于比较小的面部畸形，通过NT检查往往是看不出来的。但对于很明显的面部畸形，例如面裂这种很罕见的大畸形，才能够通过NT检查看出来。NT检查是排查染色体性疾病，判断胎儿面部畸形可以进行四维彩超检查。
NT检查主要是通过彩超检测胎儿颈部透明层的厚度，判断胎儿是否存在发育畸形的可能。NT检查选择在怀孕11周~孕13周+6进行，因为颈部透明液体是在特定的时间段内短暂性出现，时间过久就容易被淋巴吸收变成颈部皱褶。正常情况下NT值应<2.5mm，若NT值>2.5mm，则提示胎儿存在染色体疾病的风险明显增加，需进一步进行相关侵入性产前诊断，如羊水穿刺等。即使通过检查排除染色体疾患，仍建议定期进行超声监测，妊娠中期进行胎儿超声心动检查，明确胎儿有无先天性心脏病等结构问题。
胎儿面部是否畸形可以通过四维彩超检查可以判断。四维是在二维彩超检查的基础上，进一步通过特殊的成像方法来立体展示胎儿表面器官等情况，并加上时间维度参数，能够实时获取三维图像，观察胎儿的动态活动。进行四维彩超检查能更清楚的显示胎儿情况，了解胎儿的唇、脊柱裂、大脑、肾、心脏、骨骼等有无发育异常、畸形等。可在医生指导下酌情选择此方法检查，对监测胎儿情况、妊娠的进行可起到积极作用。