巧克力一般不助消化，因为巧克力含脂肪多，脂肪在胃肠道的消化吸收较慢，而巧克力不含能刺激胃肠加速蠕动的物质，因此不能助消化。
巧克力中含有铁、钙、镁、钾等微量元素和维生素，而巧克力的原料可可脂中还含有大量的铁元素，所以食用纯巧克力还有补铁的功效，缺铁性贫血患者和素食者可以适量食用。高纯度的巧克力中含有的可可碱是一种天然的反镇静成分，有助于提升精神，使神经兴奋。
由于巧克力中所含的脂肪含量比较高，所以患者在吃巧克力时，一定要注意不能吃太多，否则不仅会导致肥胖，而且还会引起腹泻、胃痛或者是腹胀等不适感。如果患者吃太多巧克力还会腐蚀牙齿，造成蛀牙的产生。巧克力中所含的可可碱会损伤神经系统和心脏，如果食用过多会引起头痛等不适症状。