总是半夜三点钟起来小便多考虑是饮水过多引起的，也可能是尿道炎、膀胱炎等疾病导致的，建议患者根据引起的原因选择合适的治疗方式。
1、饮水过多
若是睡前饮用过多水，可能会使体内水分增加，便会出现排尿增多的情况，一般不会伴随其他不适症状。这是一种正常的生理现象，可以不用过于担心，建议日常生活中保持良好的饮食结构，避免睡前过量饮水。
2、尿道炎
如果长期不注意会阴部卫生清洁，可能会导致病原菌从尿道口逆行进入尿道诱发炎症，便会出现尿频、尿急、尿痛等症状，还可能会伴随尿道口红肿、尿道分泌物增多等现象。患者可遵医嘱口服盐酸多西环素胶囊、左氧氟沙星片等药物进行改善，还要注意个人卫生清洁，勤换衣物。
3、膀胱炎
如果长期有不洁的性生活，可能会导致细菌上行诱发膀胱炎，主要表现为尿频、尿急、尿痛等，还可能会伴随尿道烧灼感、尿道瘙痒等现象。患者可遵医嘱口服阿莫西林胶囊、头孢克肟分散片等药物进行治疗，还要避免不洁性生活，注意多加休息。
除此之外，也可能是前列腺炎等疾病导致的，建议及时就医治疗，以免延误病情。