下面一般是指生殖器，生殖器刺痛有褐色分泌物可能是由于阴道炎、宫颈炎、盆腔炎等原因引起的，需要根据不同病因对症治疗。
1、阴道炎
阴道炎一般是由病原体感染、激素水平下降等原因引起的，可能会导致阴道分泌物异常，出现生殖器刺痛并且伴有褐色分泌物的情况，同时还可能会出现阴道瘙痒、性交痛等症状。可以在医生指导下使用甲硝唑片、克霉唑栓等药物方式辅助改善，平时要注意保持阴道的清洁卫生，勤换内裤。
2、宫颈炎
宫颈炎一般是由病原体感染、阴道菌群紊乱等原因引起的，可能会出现生殖器刺痛并且伴有褐色分泌物的情况，同时还可能会出现阴道异常出血、性交疼痛等症状。可以遵医嘱使用阿奇霉素颗粒、多西环素片等药物方式辅助改善，平时要注意保持性生活的卫生，避免高危性行为。
3、盆腔炎
盆腔炎一般是由生殖道感染、经期性交等原因引起的，可能会出现生殖器刺痛并且伴有褐色分泌物的情况，还可能会出现阴道分泌物增多、月经量增多等症状。可以遵医嘱使用甲硝唑片、盐酸左氧氟沙星胶囊等药物方式辅助改善，如果药物方式无法改善，可以在医院通过手术的方式进行治疗，平时要注意保持规律的作息，不要熬夜。
除此之外，生殖器刺痛有褐色分泌物还可能是由于子宫内膜炎、宫颈息肉等原因引起的，建议及时到医院通过检查明确病因，然后在医生指导下采取针对性的治疗。