秋梨膏的副作用是腹泻、腹痛、头晕、心悸以及痛经等。秋梨膏的药性偏于寒凉，大量服用有可能会导致胃肠不适，出现腹泻、腹痛等副作用。由于秋梨膏中含有大量的糖分，若食用过多极易被人体所消化吸收，导致血糖升高，甚至出现头晕、心悸等副作用。此外，长期服用秋梨膏可能会损伤身体的阳气或者导致脾胃功能变弱，所以一般症状好转后就应停服。女性在经期服用，特别是对于宫寒的女性，若服用秋梨膏可能会影响经血的排出，或者导致出现或加重痛经症状。
秋梨膏主要是以鸭梨或者雪花梨为主要原料，配合蜂蜜、冰糖以及贝母这类具有润肺、止咳、生津类的中药一起熬制而成。对于肺热引起的燥咳、胸闷、憋气、咳痰具有比较好的疗效，但不宜用茶水、牛奶送服，服用期间应忌食生冷、油腻、辛辣等不易消化及有特殊刺激性的食物以及具有解药性的食物。服用秋梨膏后出现过敏症状，如荨麻疹、皮肤瘙痒，应立即停止服用，并在医生指导下服用抗组胺类药物进行治疗，如氯雷他定、西替利嗪等。